Czy lekarz musi korzystać z KSeF?

Wprowadzenie obowiązkowego Krajowego Systemu e-Faktur budzi wiele wątpliwości wśród lekarzy prowadzących jednoosobową działalność gospodarczą. Szczególnie dotyczy to lekarzy korzystających ze zwolnienia z VAT, którzy wystawiają faktury dla szpitali lub innych podmiotów leczniczych. Pojawia się pytanie, czy tacy lekarze również będą objęci obowiązkiem korzystania z KSeF. Odpowiedź wynika bezpośrednio z przepisów ustawy o podatku od towarów i usług, które wprowadzają obowiązek wystawiania faktur ustrukturyzowanych.

Obowiązkowy KSeF również dla lekarzy

Zgodnie z art. 106ga ust. 1 ustawy z 11 marca 2004 r. o podatku od towarów i usług, faktury ustrukturyzowane wystawia się przy użyciu Krajowego Systemu e-Faktur. Przepis ten wprowadza obowiązek korzystania z KSeF dla podatników wystawiających faktury.

Obowiązek korzystania z KSeF został wprowadzony etapowo. Przepisy weszły w życie 1 lutego 2026 r., natomiast obowiązek wystawiania faktur ustrukturyzowanych obejmuje podatników:

• od 1 kwietnia 2026 r. – w przypadku większości podatników,

• od 1 stycznia 2027 r. – dla pozostałych podatników objętych późniejszym terminem.

Oznacza to, że również lekarze prowadzący działalność gospodarczą zostaną objęci obowiązkiem korzystania z KSeF.

Czy lekarz zwolniony z VAT musi korzystać z KSeF

Wątpliwości dotyczą również lekarzy korzystających ze zwolnienia z VAT. Część lekarzy uważa, że skoro są zwolnieni z podatku VAT, nie będą objęci obowiązkiem korzystania z KSeF.

Przepisy nie przewidują jednak wyłączenia dla podatników zwolnionych z VAT. Oznacza to, że obowiązek wystawiania faktur ustrukturyzowanych obejmuje również podatników korzystających ze zwolnienia z VAT.

W konsekwencji lekarz prowadzący jednoosobową działalność gospodarczą, korzystający ze zwolnienia z VAT i wystawiający faktury dla szpitala, będzie zobowiązany do wystawiania faktur przy użyciu KSeF po objęciu go obowiązkiem korzystania z tego systemu.

Faktury wystawiane dla szpitala a KSeF

Czy lekarz musi korzystać z KSeF? - lekarze często wystawiają faktury za świadczenie usług medycznych na rzecz szpitali. W takich sytuacjach mamy do czynienia z transakcją pomiędzy przedsiębiorcami, czyli tzw. transakcją B2B.

Obowiązek wystawiania faktur ustrukturyzowanych dotyczy właśnie takich transakcji. Oznacza to, że faktury wystawiane przez lekarza na rzecz szpitala będą musiały być wystawiane przy użyciu KSeF.

Zgodnie z przepisami ustawy o podatku od towarów i usług faktura ustrukturyzowana jest uznawana za wystawioną w momencie nadania jej numeru KSeF. Wynika to z art. 106na ust. 1 ustawy o VAT. Oznacza to, że wystawienie faktury poza KSeF po objęciu obowiązkiem korzystania z systemu może zostać uznane za nieprawidłowe wystawienie faktury.

Czy lekarz musi korzystać z KSeF? - podsumowanie

Lekarz prowadzący jednoosobową działalność gospodarczą, wystawiający faktury na rzecz szpitala, będzie objęty obowiązkiem korzystania z KSeF po wejściu w życie obowiązkowego systemu faktur ustrukturyzowanych. Obowiązek ten dotyczy również lekarzy korzystających ze zwolnienia z VAT, ponieważ przepisy nie przewidują wyłączenia dla takich podatników.

W konsekwencji po objęciu lekarza obowiązkiem korzystania z KSeF faktury dokumentujące świadczone usługi medyczne na rzecz szpitala będą musiały być wystawiane jako faktury ustrukturyzowane przy użyciu Krajowego Systemu e-Faktur.